МикроБиом в пробирке | Алина Бородинская

Как течёт время в баклаборатории, и почему обычный анализ крови готов за пару часов, а бакпосев нужно ждать несколько дней? ⏳

В бактериологии время и правда бежит иначе — прямо как в фильме «Интерстеллар». 🚀 Сама работа с чашкой Петри занимает не так много времени. Наш главный «тормоз» — законы природы, мы имеем дело с живыми организмами, которых невозможно заставить расти быстрее. 🧫

Между каждым действием — пересевом, выделением чистой культуры или тестом на антибиотики — нужно ждать строго 18–24 часа. 🌡️
Поэтому в бактериологии считают не календарные дни, а сутки исследований. 🗓️

Главный секрет: день сдачи не считается. 🛑

Для пациента день визита в клинику — это уже первый день ожидания. Но в баклаборатории это «день ноль».
Давайте разберем на примере, если вы сдали анализ 1 октября утром:

•1 октября (День сдачи): Анализ привозят в лабораторию и сеют на питательные среды. 🔬 Визуально на чашках Петри пока ничего не видно — они сразу отправляются в термостат инкубироваться в тепле до следующего утра. 🧪

•2 октября (1-е сутки лаборатории / 2-й день для вас): Микробы всю ночь росли. 🦠 Специалисты впервые оценивают чашки. Если обнаруживается рост, бактерии пересевают отдельно, чтобы накопить чистую культуру для дальнейших тестов. 🧫 Первичные чашки возвращаются в термостат.

•3 октября (2-е сутки лаборатории / 3-й день для вас): Врачи смотрят, не выросло ли на первичных чашках что-то новое (если да — процедуру отсева повторяют). 🔍 Параллельно работают со вчерашней чистой культурой: запускают её идентификацию и определение чувствительности к антибиотикам. 💊

•4 октября (3-и сутки лаборатории / 4-й день для вас): Бактериологи получают точное «имя» первой культуры и видят, какими лекарствами её можно победить.📋 Повторяют круг с идентификацией и постановкой чувствительности к антибиотикам со второй культурой. ⏱️

•5 октября (4-е сутки лаборатории / 5-й день для вас): Специалисты оценивают культуру, которая выросла позже, объединяют данные, вносят финальный результат в базу и отправляют его вам. ✉️

Важно при вечерней сдаче: 🌆 Если вы сдали анализ вечером, график сдвигается вперед еще на сутки. День забора и день доставки в лабораторию здесь не совпадают. Поэтому мысленно игнорируйте первые два дня (день сдачи и день доставки). 🚫
В этом случае 3-й день с момента визита в клинику станет для лаборатории только 1-ми сутками роста. ⏰

Как правильно планировать визит к врачу? 🩺
Учитывайте время сдачи. Если сдавали утром — не считайте день сдачи, начинайте отсчет со следующего дня. Если сдавали вечером — смело пропускайте первые два дня. 🗓️

Отрицательный результат:
если в посеве вообще никто не вырос, вы можете получить результат уже на 2-3-и сутки, так как не нужно накапливать, идентифицировать культуру и определять к ней чувствительность к антибиотикам. 🥂

Но при записи в врачу, все же заложите минимум 5 полных дней. Если анализ сдан утром 1 октября, идеальное время для записи — 6 октября. 📆 Тогда готовый бланк точно будет у вас на руках. 📄

Везде есть свои особенности, это общая схема, чтобы понимать, что происходит с анализами внутри лаборатории. Какие-то анализы готовы уже через 3 дня (2 суток лаборатории), а какие-то все 6 дней (5 суток лаборатории). Далее разберем эти случаи.

Подробно перечни антибиотиков в слайде про результаты не раскрывала, они на переосмыслении.

#бактериология_МикроБиом
#врачам_МикроБиом
#пациентам_МикроБиом

Когда мокрота пациента пахнет... сигаретным дымом и выросла плесень 🚬💨

Провокационный заголовок, но так ли всё банально на самом деле? 🤔
Мокрота поступила на бакпосев 🧫. При посеве лаборант почувствовала сильный табачный запах... и в итоге выросла плесень!!! 😲

Каждая мокрота перед посевом подвергается микроскопированию 🔬. Качественно собранным материалом считается образец, в котором мало плоского эпителия . А вот если в нем много нейтрофилов — значит, перед нами активный инфекционный процесс 🦠.

Мокроту мы микроскопировали по Граму: для поиска бактерий 👾 и оценки обилия плоского эпителия.
Ещё я крашу по Романовскому, чтобы детально рассмотреть клеточные элементы.

В данном образце было всего 2–3 клетки плоского эпителия в поле зрения и большое количество альвеолярных макрофагов 🎯.

Перед нами один из самых послушных пациентов — сбор выполнен очень качественно! ✨ Наличие альвеолярных макрофагов свидетельствует о том, что образец получен из глубоких отделов лёгких 🫁.

Почему макрофагов так много? 🤷‍♂️
Эти клетки — наша внутренняя служба очистки 🧹. В норме они защищают легкие от бактерий. Но у пациентов с большим стажем курения, макрофаги вынуждены буквально «поедать» тонны осевших смол, копоти и токсинов. Их количество увеличивается в разы, так как организм отчаянно пытается санировать дыхательные пути 🚨.

Заключение по микроскопии 📋: биоматериал — мокрота, много макрофагов, нейтрофилов нет.

Далее — бакпосев 🧫. На питательных средах выросли единичные колонии нормальной микрофлоры зева 🌱. Это было ожидаемо: чем меньше плоского эпителия ротовой полости попадает в образец, тем ниже контаминация нормофлорой.

Но на среде Сабуро, которая используется для выявления грибов, обнаружилась плесень 🍄. Она разрослась буквально за 2–3 дня, как вата, полностью заполнив чашку Петри 🧫. Черные точки — это споры, а запах от нее тот ещё! 🤢

Амбулаторный специалист мог бы ликовать, но это отличный пример того, почему нельзя верить исключительно посевам ❌.

Давайте проанализируем факты:
🔹 В мокроте нет нейтрофилов.
🔹 Нет мицелия грибов.
🔹 На первичной чашке плесени изначально не было. Скорее всего, это контаминация (загрязнение), которая не имеет отношения к самой мокроте.

Эти грибы живут повсеместно 🌍. Спора могла попасть из воздуха или пациент просто вдохнул её накануне, но никакого воспалительного процесса, вызванного этой плесенью, у него нет 🌬️.
Здесь причина кашля кроется не в микробах 🙅‍♂️. Поэтому нужно критично относиться к результатам посевов 🧐, обязательно микроскопировать биоматериал и не поддаваться соблазну выдать случайную находку за серьезную патологию, которая лишь введёт лечащего врача в заблуждение 💡.

#бактериология_МикроБиом
#врачам_МикроБиом
#пациентам_МикроБиом

Всем привет! Не теряйте меня 🙌

Я тут временно пропала и ушла с головой в адаптацию уже выпущенных текстов для запрещённой сети. И это оказалось безумно увлекательным процессом!
Там кипит творческий процесс. Подбираю музыку на посты, накладываю тексты на красивые сгенерированные фоны, выверяю каждый миллиметр, чтобы всё смотрелось эстетично и правильно.😉

Как только обе площадки догонят друг друга по контенту, я обязательно вернусь сюда в прежнем режиме и буду вести их параллельно.
Я скоро! ❤️

От микста к чистой культуре 🧫

Когда в лабораторию поступает биоматериал, там чаще всего находится целый «коктейль» из разных микроорганизмов. Но поставить тест на чувствительность к антибиотикам по такой смеси нельзя — результат будет неверным.

Главное правило клинической микробиологии — работать только с чистой культурой возбудителя.

Мы отсеваем чистые бактерии на отдельные сектора - как кусочки пиццы, чтобы накопить их биомассу.

А то, что находится в смеси, необходимо разобщить.
Смотрите, как четко разделились голубая и прозрачная культуры - в верхней части чашки.

На этом рассеве целью было выделить изолированно голубой Энтерококк - цель достигнута. Теперь он готов к главному тесту - отправиться на постановку чувствительности к антибиотикам.

Только выделив чистую культуру, можно гарантировать точность и достоверность результатов антибиотикограммы.

#бактериология_МикроБиом
#врачам_МикроБиом
#пациентам_МикроБиом

🧑‍🤝‍🧑 🩺Продолжаем наш сериал про дыхание бактерий.🎬

Шиванеллы и клостридии показали, что микромир очень интересен, необычен и разнообразен. Даже с дыханием обычным кислородом не всё так просто. Кислород для бактерий — это и великое благо (даёт кучу энергии), и страшный яд (окисляет и разрушает всё на своем пути). 🧪

По отношению к O2 бактерий можно разделить на четыре лагеря, и характеры у них те еще: 🤔

1️⃣ Облигатные аэробы (Кислородные фанаты). 🌬 Им воздух нужен так же, как и нам, без него они погибнут. Они не умеют ничего другого, кроме как дышать кислородом. Кислород — конечный акцептор электронов в их дыхательной цепи. 🧬

Они живут непосредственно в воздухе или на поверхностях, которые с ним постоянно контактируют (например, на нашей коже) — там, где ветрено и светло. ☀️

К этой группе относится грозная, но неповторимая синегнойная палочка (Pseudomonas aeruginosa), микрококки, например Micrococcus luteus. 🦠

2️⃣ Факультативные анаэробы (Универсальные солдаты). ⚔️ Самые хитрые ребята. Есть кислород? Отлично, дышим полной грудью. Кислород закончился? Не проблема, переходим на брожение. 🔄

Они способны выживать практически в любых условиях — от поверхности кожи до глубоких полостей тела. 🛡Сюда относится большинство известных бактерий. Например, стафилококки (Staphylococcus spp.), стрептококки (Streptococcus spp.) и кишечная палочка (Escherichia coli). 🧫

3️⃣ Микроаэрофилы (Самые прихотливые и капризные). 👑 Кислород им жизненно необходим, но немного — от 2% до 10%, пожалуйста, и повышенную концентрацию углекислого газа.😎

21% кислорода, как в воздухе, для них смертелен — у них развивается стресс, только окислительный, от которого они гибнут. 💔

Классические примеры — хеликобактер пилори (Helicobacter pylori), живущий под плотным слоем слизи в желудке, и кампилобактер (Campylobacter). 🦠

4️⃣ Облигатные анаэробы (Кислородоненавистники). 🚫 Они получают энергию только путем брожения или анаэробного дыхания - дышат серой, железом...

🔋Они стараются жить там, куда воздух не проникает — в глубоких слоях почвы, иле, а также в глубинах нашего кишечника и репродуктивного тракта.🌋

Сюда относятся уже известные клостридии (Clostridium), бактероиды (Bacteroides) — главные жители нашего кишечника, а также сарцины, например, Sarcina ventriculi, которые спасаются от воздуха в желудке. 🧫

Встреча с кислородом в теории должна приводить анаэробов к немедленной смерти, но это не всегда так.🛡
На самом деле опасен не сам кислород, а его активные формы (радикалы). И опасны они абсолютно для всех — даже для нас с вами.

Радикалы образуются в любой клетке, куда попадает кислород. Чтобы выжить, организмы используют ферменты — в основном каталазу и супероксиддисмутазу.⚡️

Некоторые виды анаэробов накапливают достаточно ферментов, и для защиты от радикалов их хватает на несколько минут, а у кого-то даже часов.
Но существуют и «безоружные» анаэробы: гены этих ферментов отсутствуют полностью, поэтому контакт с воздухом убивает их мгновенно. 🧟

✨ Меня больше всего привлекают анаэробы, потому что видим мы их крайне редко (ну, кроме клостридий и бифидобактерий). Да и сам факт «дышать чем-то кроме кислорода» — серой, азотом или железом — кажется чем-то необыкновенным. ☄️

#бактериология_МикроБиом #ПЦР_МикроБиом
#удивительный_МикроБиом
#пациентам_МикроБиом
#врачам_МикроБиом

✨ В нашей практике, если вырастают плесневые грибы, мы их не идентифицируем, так как работаем только с дрожжеподобными грибами.
Но одна из моих профессиональных мечт — научиться идентифицировать плесени и качественно определять их чувствительность к антимикотикам.
К тому же сейчас мы активно развиваем ПЦР-направление по диагностике дерматомикозов. 🔬

Поэтому сегодня я не смогла пройти мимо этой плесени, которая выросла на среде Сабуро в виде пушистой колонии с радиальной складчатостью. 😍

Сделала слепок с колонии покровным стеклом.
Красила тем, что было под рукой, а был только генцианвиолет, но мне и так красиво! 💜

Под микроскопом отчетливо видны гифы гриба и конидиеносцы, на верхушках которых расположены кисточки с шарообразными спорами (конидиями). На основе этих признаков и фото в интернете я предположила, что это Penicillium. 🔍🦠

Он обитает повсеместно в природе — в почве, воздухе и на продуктах (именно он оседает сине-зеленым бархатом на забытом хлебе) 🍞

Главный медицинский триумф XX века: из этого гриба Александр Флеминг выделил первый в мире антибиотик — пенициллин, спасший миллионы жизней 💊💉

Благородные виды (P. roqueforti, P. camemberti) дарят неповторимый вкус и аромат сырам Рокфор, Горгонзола и Камамбер 🧀🍷

Для здорового человека он почти безвреден, но у пациентов с выраженным иммунодефицитом способен вызывать серьезные заболевания (пенициллиозы) ⚠️

#мой_взгляд_МикроБиом

Тревожная подготовка к новому учебному году закончилась, 1 сентября прошло, а значит — можно и продолжить писать! 🔔🍁

В прошлый раз мы обсудили шеванелл, которые умеют дышать кислородом, но когда его нет — «дышат камнями» и отращивают специальные выросты, чтобы принудительно скинуть на них электроны. 🪨⚡

А вот пример бактерий, которые вообще не умеют дышать! 😱 У них дыхательной цепи, как у нас или у тех же шеванелл, нет в принципе, и получают они энергию исключительно путем брожения.🔋

Это Клостридии, которые мы выявляем на среде Вильсона — Блера в анализе на дисбактериоз. И если уж его и сдавать (о чем сейчас в медицине идут большие споры 🩺🤔), то хотя бы для того, чтобы мы могли наблюдать в лаборатории вот такую невероятную красоту! 😍🔬

Клостридии считаются облигатными анаэробами. То есть они не дышат кислородом и погибают в его присутствии... но не все! 🤭🔥

Среда Вильсона — Блера — это классика не только для диагностики дисбактериоза. 👌 Наши коллеги из санитарной микробиологии активно используют её для контроля качества воды и почвы, ведь клостридии — это маркер давнего фекального загрязнения! 💧💩 На ней же проверяют безопасность пищевых продуктов и консервов на наличие возбудителей тяжелых токсикоинфекций. 🥫☣️ А в стационарах на Вильсона — Блера экстренно сеют материал, когда у пациента есть подозрение на газовую гангрену. 🏥🚨

На этой селективной среде клостридии растут в виде крупных, интенсивно черных колоний, окруженных загадочным угольно-черным облаком! 🌑

Почему же среда так эффектно чернеет вокруг колоний клостридий? 🤔🌋
В неё специально добавляют много сульфита натрия и солей железа.🧂 У клостридий есть мощный фермент сульфитредуктаза, с помощью которого они восстанавливают сульфит до сероводорода H₂S. 💨 Образующийся сероводород тут же соединяется с железом, и образуется сульфид железа FeS. 💥 Он абсолютно нерастворим — мгновенно выпадает в осадок и окрашивает колонии вместе с окружающей средой в черный цвет! 🖤

Иногда мы можем наблюдать разрыв агара, появление пузырей и полное отслоение столбика от дна пробирки — это классический визитные признак Clostridium perfringens. Они активно ферментируют глюкозу из среды Вильсона-Блера с бурным выделением газа.🌋💨 Другие же виды клостридий могут расти в виде круглых черных «шариками» без единого пузырька. Отсутствие разрывов агара вовсе не означает, что клостридий в пробирке нет.💡

Клостридии под микроскопом 🔬— это крупные палочки с закругленными краями. Они могут располагаться одиночно, парами или выстраиваться в короткие цепочки. ⛓️
С помощью специального метода окрашивания по Граму 🎨 (Грам - это фамилия ученого, который изобрел этот гениальный способ) клостридии окрашиваются в насыщенный синий цвет. 🌌

Если инкубировать пробирку в термостате 48 часов и больше, культура начинает стареть и образует споры. Спорообразование - это защитный механизм, который помогает выжить в самых экстремальных и неблагоприятных условиях. Бактерия погибнет, а спора останется жить до лучших времен.⏳

В мазке по Граму сами споры не прокрашиваются и остаются прозрачными. Но так как плотная спора формируется внутри клетки и по размеру превосходит её, она сильно раздувает бактерию изнутри. И клетки становятся похожими на барабанные палочки или теннисные ракетки. 🏓🥁 Но если культура еще совчем молодая, спор в мазке может и не быть — и это абсолютно нормально.

Вот такие они — загадочные, пугающие и одновременно прекрасные жители микромира. Но самое интересное я приберегла на потом...ведь некоторые клостридии плевать хотели на правила и совершенно не боятся кислорода, они им не дышат, но и не погибают.
Разберем этот детектив в следующих постах! 🧪
Всем легкого старта в новом рабочем и учебном сезоне! 🍁🔔

#бактериология_МикроБиом

Мне хочется рассказать про того, кого я не увижу на чашках Петри, не выделю от пациентов, а буду купаться летом в речке и знать, что она где-то рядом... вырабатывает ток прямо у моих ног, утопающих в иле. 👣

В бактериях меня привлекают необычное «поведение», жизнь в экстремальных условиях, альтруизм и проявление социального поведения, то, как они чувствуют среду вокруг 🧬. От них, таких, на первый взгляд, простых, пошла жизнь, поэтому я их искренне люблю и ими восхищаюсь.

Одна из таких удивительных бактерий — Shewanella oneidensis, которая буквально дышит металлом, генерирует электрический ток и сбрасывает его наружу через специальные выросты на мембране клетки. ⚡️

Впервые её детально изучили в США, выделив из озера Онейда, в честь которого она и получила своё название. Но встречается она по всему земному шару. 🌍

И что ещё более удивительно: эта бактерия может дышать кислородом. Но если она окажется в экстремальных условиях, где темно, глубоко и кислорода нет, а вокруг только камни — она будет дышать камнями 🪨. Шеванелла даже не брезгует сточными водами и загрязнёнными почвами 🏭.

Так как она это делает и зачем ей отращивать эти самые выроста на поверхности своей клетки? 🔬 Чтобы это понять, нужно вспомнить, как дышим мы с вами...

Если говорить максимально просто: дыхание — это процесс, при котором клетка разбирает еду на запчасти, забирает у неё энергию в виде электронов и упаковывает эту энергию в «биологические батарейки». 🔋

Нашей едой является глюкоза, в которой заложена химическая энергия. В наших митохондриях есть цепочки белков (дыхательная цепь), которые передают электроны друг другу ⛓. В самом конце их принимает акцептор электронов — кислород, в результате чего образуется вода и наша главная биологическая батарейка — молекула АТФ 🌬💧. Но чтобы у нас осуществился весь этот процесс, нужно, чтобы кислород попал внутрь клетки.

А вот камни, в которых есть железо и марганец, никак не могут попасть в клетку к Шеванелле 🪨. И вот тут проявляется гениальность природы. Бактерия отращивает туннель, внутри которого продолжается дыхательная цепь, и передаёт электроны вовне — на конечный акцептор, который находится в окружающей среде и не может проникнуть сквозь мембрану её клетки. Благодаря этому она может дышать железом, марганцем, ураном и другими металлами 🦾.

Шеванеллу также используют для очистки воды от тяжёлых металлов 🧪. Передавая свой электрон на какой-нибудь растворённый в воде хром, она меняет его валентность и переводит в нерастворимую форму. Образуется осадок, который затем можно отфильтровать 🦺.

Вот такие удивительные бактерии обитают совсем рядом с нами. Их находили и в сибирских реках, и в небольших прудах, и в прибрежном морском песке 🌊. В следующий раз, заходя жарким летом в прохладную речную воду, задержитесь на секунду. Там, в глубоком тёмном иле, крошечные и гениальные Шеванеллы тянут свои нанопровода к камням, напоминая нам: природа гораздо удивительнее, чем мы привыкли думать ✨.

https://clck.ru/3VT3tQ

#удивительный_МикроБиом

Спасибо первым недождливым августовским выходным! 🌤️ Эта поездка была запланирована давно, а реализована только вчера.

Мирон обожает железнодорожный транспорт — это его узкий интерес буквально с сотворения мира. 🚂 Иногда мы устраиваем себе мини-путешествия на электричке: мы уже были в Ижевске, Нижнем Новгороде и Йошкар-Оле. Вчера маршрут был близкий — в Зеленодольск. 🧭

Когда-то я была здесь на спортивной лыжной базе, где летом можно кататься на велосипедах прямо посреди леса, рядом с озером. 🚴 Я очень мечтала, что однажды приеду сюда вместе с Мироном. ✨

У нас было так много планов на этот день! Но время пролетело слишком быстро: в итоге мы только покатались на базе, перекусили во «Вкусно — и точка» 🍔, а еще успели прокатиться на городском автобусе и самокатах. Зеленодольск — очень милый и ухоженный город. Я как раз люблю такие: маленькие, уютные и спокойные. 🏡

На базе проходили линии ЛЭП, и Мирон заворожённо слушал ток: такой глубокий гул, треск и щелчки. ⚡ Мирон сказал, что звук похож на сверчков и цоканье велосипеда. 🦗

И мне пришла идея, рассказать вам про Shewanella oneidensis (Шеванелла), которая дышит не кислородом, а металлом, живёт в глубине ила и вырабатывает ток. 🔋

Но это будет завтра. А сегодня предлагаю посмотреть видео нашего маленького путешествия и взять Зеленодольск на заметку для своих будущих поездок. 🎬

✨ Что стало с моим браслетом из эппендорфов, который я сделала для фотосессии? Ответ простой — он пророс и отправился в бикс с отходами класса Б. 🤭🗑️

Для фотосессии очень хотелось сделать какой-то акцент на сферу деятельности, связанную с бак- и ПЦР-диагностикой. Мне в голову пришла идея разлить среду Олькеницкого, которую мы используем для первичной биохимической идентификации Энтеробактерий, в микропробирки ПЦР. В одну из суббот мои фельдшеры постарались и разлили среду. А уже перед фотосессией я просто закрепила пробирки на самом дешёвом браслете. 📿

Почему же пробирки проросли? 🦠Я очень много раз открывала и закрывала эппендорфы во время сборки, микроорганизмы воздуха и кожи попали на питательную среду и начали расти. Среда в эппендорфах поменяла свой свет на более оранжевый и малиновый.
Я, конечно, надеялась, что среда подсохнет, останется стерильной и сохранится как сувенир на память. А остались только фото. Ну и да ладно, они тоже получились отличными! 📸

#мой_взгляд_МикроБиом