Бывало такое, что вроде бы всё настроено правильно, но новая катушка ведёт себя совсем иначе?

Это нормально. Даже пластик одного типа от разных производителей может отличаться по составу, диаметру, качеству намотки и рекомендуемым условиям печати.
Поэтому при смене катушки полезно сначала напечатать небольшой тест, а уже потом запускать большую модель.