В Пятигорске Шойгу высказался о деятельности некоммерческих организаций (НКО), «пытающихся вести деструктивную работу в России»:

«Этот вопрос находится в зоне постоянного внимания наших служб — МВД, ФСБ, Росфинмониторинга, Роскомнадзора, большая роль отводится и главам регионов. Наши службы довольно успешно занимаются этим вопросом. В нынешних условиях это направление имеет архиважное значение…

После анализа деятельности НКО из нескольких сотен осталось около 30 — тех, кто действительно занимается той работой, которую декларируют…

НКО в целом несут важную и полезную миссию, занимаются нужным для людей и страны делом — помощь здравоохранению, детям, старикам, спорту, экологические проекты. Но вместе с тем мы не можем не замечать, что, как правило, под зонтиком этих организаций появляются и те, кто играет деструктивную роль по влиянию на настроения в стране, нарушению стабильного состояния страны…

Если провести две параллели — появление НКО такого рода и цветные революции, то они будут во многом совпадать. То есть появление таких организаций, преследующих совершенно конкретные цели, является предвестником, маркером цветной революции, которая ведет к смене власти, развалу страны, серьезным потрясениям».