В этом году сотрудники нашей научной группы, Марина Протопопова и…

В этом году сотрудники нашей научной группы, Марина Протопопова и Василий Павличенко, прошли обучение по курсу «Секвенирование и анализ растительного генома» на базе Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН. Обучение стало возможным благодаря поддержке Президентского фонда природы (@fondprirody) и партнера нашего проекта – компании SkyGen. Основной нашей задачей было освоение подходов нанопорового секвенирования для дальнейшего анализа генома реликтовых растений.

Программа была максимально прикладной и интенсивной: 13 дней ежедневной работы по 8–9 часов. В роли преподавателей выступили ведущие эксперты в области анализа растительного генома, а также молодые биоинформатики из лаборатории геномики растений ИОГен РАН и Сколтеха.

За две недели нам удалось:
• ознакомиться с особенностями секвенирования растительного генома с упором на современные нанопоровые технологии
• самостоятельно подготовить библиотеки для нанопорового секвенирования геномов нескольких образцов растений
• пройти мастер-класс по анализу полученных библиотек на нанопоровом секвенаторе
• провести сборку экспериментального растительного генома
• выполнить аннотацию и предварительный анализ полученных геномов с помощью биоинформационных подходов
• получить удостоверения о повышении квалификации!

Главный итог курса – каждый участник уехал с самостоятельно собранным геномом! Полученные навыки и новые подходы мы обязательно интегрируем в текущие исследовательские проекты нашей научной группы, и, главным образом, для изучения генетического разнообразия реликтовых видов растений.

Выражаем огромную благодарность организаторам и лекторам за насыщенную программу, участливое отношение к студентам курса и мощный багаж практических знаний!
#GameOfGenes
#ФондПрироды
#ПрезидентскиеГранты